将一根细长的探针放进样品容器,依托机器视觉系统识别,20秒内就能对单个细胞精准吸取,并将其注入纳升级微反应器。通过一旁显微镜的传输画面,记者看到,在探针视角下,容器中各个细胞如棋子般分布,位置清晰可见。
日前,由浙江大学杭州国际科创中心生物与分子智造研究院教授方群团队研制的全自动单细胞蛋白质组分析平台正式发布。方群介绍,这个分析平台就像一个强大的“细胞解读器”,能以单个细胞为单位,精确检测其蛋白质的表达情况,从而揭示细胞间的共性和差异。这项研究为理解细胞生长发育、疾病发生发展以及药物研发提供了全新视角和工具。
按照基因组、转录组、蛋白质组等具体分析目标细分,单细胞分析技术可分为不同路线。由于蛋白质无法在体外进行扩增,相较单细胞基因组学和转录组学技术而言,单细胞蛋白质组学技术发展相对滞后。在一个细胞中,蛋白质的总含量约为0.2纳克,质量仅相当于一只蚂蚁的千万分之一。而且组成这0.2纳克蛋白质的是近2万种不同种类的蛋白质,在单细胞水平上进行蛋白质组分析的难度可想而知。
方群介绍,在单细胞水平上对细胞内表达的全部蛋白质(蛋白质组)进行定性和定量分析,是揭示细胞类型及其状态必不可少的工具,在肿瘤异质性、干细胞分化、生殖细胞发育、神经细胞分析等领域有重要应用价值。此前,单细胞蛋白质分析技术已有基因编码荧光蛋白标记法、基于抗体或核酸适体的标记法等手段,但这些手段在单细胞蛋白质鉴定深度方面均存在较大局限性。
多年来,方群团队致力于微流控单细胞蛋白质组分析技术的研究。所谓微流控,指的是在微米级结构中操控微量液体的技术手段。此次研究中,该团队基于前期研制的纳升级微流控液滴操控机器人和“点取式”单细胞蛋白质组分析工作流程,建立了全自动单细胞蛋白质组分析平台。该平台由机器人负责样品转运,平台集成细胞分选与捕获、纳升级体积样品前处理、色谱进样和分离、质谱检测和数据分析等操作环节。方群介绍,应用微流控技术能显著提升反应效率,降低样本损失。在该平台工作流程下,单份样品进行样品前处理中的液体体积,是常规手段下的几十分之一。
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